Faculté des Sciences Biologiques et des Sciences Agronomiques

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Polycopié de biochimie structurale
(Université Mouloud Mammeri, 2019) Lefsih, Khalef
La biochimie est une discipline ramifiée qui demande des connaissances de plus en plus transversales. Réussir le module de biochimie structurale exige de l’étudiant d’avoir de solides connaissance en chimiques et en chimie organiques plus spécialement. On se félicite de mettre entre les mains de nos étudiants ce polycopié dont on a pris le soin {ce qu’il englobe l’essentiel du programme. On a voulu que ce polycopié soit clair, concis et bien focalisé sur l’essentiel en évitant qu’il soit trop littéraire. Il est enrichi en structures chimiques claires et nettes, des réactions simplifiées, diagrammes récapitulatifs et de belles illustrations colorées. Le polycopié commence par des rappels très importants sur les notions d’isomérie, stéréochimie et de chiralité pour faciliter {l’étudiant de mieux comprendre la logique des différentes représentations, configurations et conformations utilisées dans différents chapitres. Les quatre chapitres qui s’en suivent traitent des glucides, des acides aminés et protéines, des acides nucléiques et les lipides. Chaque chapitre détaille la classification et structure, en respectant les dernières recommandations de l’IUPAC, ainsi que les propriétés physico-chimiques de chaque entité chimique dont il traite. Ce polycopié se termine par une liste de références renfermant les livres fondamentaux les plus consultés en biochimie.
Ecotoxicologie
(Université Mouloud Mammeri, 2020) Smail, Adel
Ce cours d’Ecotoxicologie destiné aux étudiants du Master 1 Eau et Environnement est divisé en six chapitres. Arès une introduction, le chapitre 1 traite de l’écotoxicologie, du domaine d’intervention de l’écotoxicologie et de la pollution en général. Le second chapitre aborde le problème de la pollution de l’écosphère et les causes de la pollution de la biosphère. Le chapitre 3 traite de la santé humaine, des maladies émergentes et recrudescence, de la pollution environnementale des maladies de la persistance, bioaccumulation et amplification biologique des agents polluants, des cas des enfants et de leur exposition aux produits. Ce chapitre aborde également le problème de l’identification les substances responsables du cancer. Dans le chapitre 4 seront étudiés les effets des produits toxiques (polluants) sur les populations et les écosystèmes avec la mise en évidence de l’effet des pesticides sur les organismes et les écosystèmes. Le cinquième chapitre abordera une notion très importante concernant la surveillance permanente de l’environnement qu’est le monitoring des polluants. Quand au chapitre 6 il concernera la prise de décision et l’estimation des risques.
Polycopié de cours reproduction et embryologie et approfondie. Adapté au Master de Biologie
(Université Mouloud Mammeri, 2022) Akdader née Oudahmane, Samira
L’embryologie est la science qui se consacre à l'étude du développement de l'embryon, c'est-à-dire à la période de la vie comprise entre la fécondation de l'œuf et la naissance. Aussi, c’est l'étude du développement de l'être vivant (Ontogenèse). La reproduction est le processus par lequel les organismes se répliquent. C’est aussi l’un des concepts les plus importants en biologie : cela signifie faire une copie, une ressemblance, et ainsi assurer la survie des espèces. Le présent cours est axé sur l'acquisition des notions de bases qui sont fondamentales et nécessaires pour la compréhension des grands mécanismes impliqués dans la formation des crêtes génitales et colonisation par les gonocytes primordiaux, jusqu’à la formation d’une gonades bien différenciée de l'embryon. Il a également pour objectif, les connaissances des processus fondamentaux mis en œuvre dans la gamétogenèse et la reconnaissance inter-gamétique, sur la régulation hormonale et paracrine des fonctions reproductrices.
Cours de microbiologie générale destiné aux étudiants L2 Ecologie et Environnement
(Université Mouloud Mammeri, 2023) Tabli, Nassira
Les micro-organismes aussi appelés microbes forment un ensemble d’organismes vivants microscopiques, invisibles à l’œil nu. C’est leurs seul points communs car ils diffèrent et varient par leur morphologie, leur physiologie, leur mode de reproduction et leur écologie. Les micro-organismes sont les plus petits des êtres vivants et les derniers à être découverts, ils n’ont pu être observés qu’avec l’avènement des premiers instruments optiques grossissants. Après une introduction générale, le présent manuscrit est scindé en sept principaux chapitres, à savoir ; une introduction générale au monde des microbes, suivie d’un chapitre détaillant la structure et la morphologie de la cellule bactérienne, les chapitres trois et quatre sont focalisés sur la nutrition et la croissance de la cellule bactérienne. Un chapitre sur la classification détaillée des bactéries, suivis d’un autre sur les agents antimicrobiens, le dernier chapitre est consacré à quelques notions de Mycologie et de Virologie, pour en finir par une liste de références bibliographique. Ce travail est un appui pour les étudiants de deuxième année Biologie de différentes spécialités. Les différents chapitres détaillés sont accompagnés avec des illustrations et des figures permettent de bien assimiler le contenu.
Interactions microbiennes dans les écosystèmes
(Université Mouloud Mammeri, 2024) Lembrouk, Lillia
Ce document a été rédigé avec l’espoir qu’il servira de support de cours aux étudiants inscrits en Licence Biologie des Organismes. Le schéma général de ce manuscrit correspond au programme de la matière qui est une unité méthodologique dans leur cursus d’enseignement. La vie sur Terre est complexe et interactive où les organismes formant des populations qui, à leur tour, forment des communautés, ou écosystèmes. L'écologie de ces derniers est basée sur les interactions entre les espèces et leur composition au sein de ce système qui régit la sélection naturelle, l'évolution et la composition génétique. L'aptitude à la survie d'un organisme dans un écosystème ne dépend pas uniquement de l'espèce, mais inclut les interactions des autres organismes avec cette espèce. Les interactions, entre et parmi les espèces, au sein d'un écosystème peuvent être aussi complexes, malgré qu’il y’a longtemps, il a été considéré qu’elles étaient uniquement de nature inhibitrice. Cependant, les derniers développements de la recherche ont démontré que dans notre environnement, il existe plusieurs classes de microorganismes qui produisent différents produits lors de l'interaction et qui englobent donc un champ plus large d'aspects utiles et potentiellement précieux au-delà de la simple antibiose. Le présent travail explore donc différents types d'interactions microbiennes dans les écosystèmes et décrit le rôle de divers facteurs physiques, chimiques, biologiques et génétiques qui régulent ces dernières, et explique également le mécanisme d'action de la formation des biofilms et le rôle des métabolites secondaires dans la régulation de l'interaction bactéries-fongus. L'accent est mis sur les interactions microbiennes qui sont importantes dans divers domaines des sciences de la nature et de la vie tels qu’en médecine, dans l'industrie alimentaire, dans l'agriculture et dans l'environnement. En bref, ce polycopié fournit une vue d'ensemble des différentes contributions de l'interaction microbienne dans la nature et leurs différentes applications.
Biotechnologie des microalgues
(Université Mouloud Mammeri, 2024) Bouacem, Khelifa
Le terme « microalgues » regroupe de façon générale les microorganismes photosynthétiques de quelques microns à quelques dizaines de microns se développant en milieu aqueux. Outre les microalgues proprement dites, cette famille englobe les cyanobactéries. Ces microorganismes sont riches notamment en protéines, lipides ou en molécules particulières aux activités biologiques fortes ou aux propriétés fonctionnelles originales. Les microalgues présentent une diversité plus grande que celle de toutes les plantes terrestres. Il existerait sur le globe au moins 200 000 espèces différentes.Elles constituent un vaste assemblage d’organismes phylogénétiquement éloignés.La physiologie, la biochimie et la biologie moléculaire montrent que les groupes d’algues en apparence très homogène en termes de morphologie, d’ultrastructure plastidiale, de composition pigmentaire, n’ont pas pour autant une relation évolutive étroite. Les microalgues présentent diverses caractéristiques intéressantes pour un grand spectre d’applications dans différents domaines à savoir: l’alimentation humaine et animale, la production d’énergie (biocarburants) et la production de molécules à hautes valeurs ajoutées pour des fins industrielles, notamment les domaines pharmaceutique et cosmétique. Etant donné la diversité des applications industrielles et des exigences nutritionnelles et environnementales de la culture des microalgues, la mise en place d’un système de culture efficace est une étape spécifique et cruciale selon l’application considérée. La culture à l’échelle laboratoire et semi-industrielle est déjà bien étudiée, connue et est maitrisée, ce qui n’est pas encore le cas pour la culture à grande échelle. Deux moyens principaux de cultures de microalgues ont été développés, aussi bien à l’échelle laboratoire qu’à l’échelle industrielle. Les systèmes ouverts où une partie importante de la culture est exposée à l’atmosphère sont communément appelés bassins. Les systèmes fermés où les cultures n’ont pas, ou peu de contact direct avec l’atmosphère sont appelés des photobioréacteurs.
Phytopathologie partie virus, viroïdes et phytoplasmes
(Université Mouloud Mammeri, 2024) Chougar, Safia
La phytopathologie est une discipline scientifique qui s’intéresse à l’étude des maladies des végétaux causées par des les bactéries, les champignons et les virus. Ce présent polycopié s’intéressera à la partie virologie, qui est elle-même une partie du module de phytopathologie destiné à des étudiants de Master en Protection des Végétaux. En effet, cette partie de module englobera les virus, viroïdes et phytoplasmes. Les phytovirus sont des nucléoprotéines qui causent des dégâts importants sur les organismes végétaux. Ils peuvent prendre plusieurs formes et les attaques virales peuvent se traduire par plusieurs symptômes qui affectent les plantes. La réplication virale comprend plusieurs étapes qui sont : la pénétration dans la cellule hôte, décapsidation, réplication du génome, synthèse des composants viraux, assemblage et encapsidation et enfin libération. La transmission peut se faire via une voie avec vecteur horizontal (externe) ou sans vecteur vertical (interne). Les viroïdes quant à eux sont plus petits que les virus, ils attaquent exclusivement les plantes économiquement importantes. Les phytoplasmes sont des microorganismes bactériens qui attaquent essentiellement des plantes hôtes dicotylédones. Le diagnostic représente deux composantes complémentaires, qui sont les symptômes observés sur la plante et les symptômes observés à échelle cellulaire. Le diagnostic peut être biologique ou sérologique.
Environnement et développement durable
(Université Mouloud Mammeri, 2024) Berrached, Rachda
Le cours de « l’environnement et développement durable » est destiné aux étudiants de la deuxième année des Sciences de la Nature et de la Vie. L’environnement représente l’ensemble des conditions physiques, chimiques, biologiques, climatiques, géographiques et culturelles dans lesquelles se développent les êtres-vivants. L’environnement inclut donc, l’air, la terre, l’eau, les ressources naturelles (énergie solaire, pétrole, etc.), la flore, la faune, les micro-organismes, l’Homme et leurs interactions. Quant au développement durable, celui-ci correspond à un à un mode de développement qui répond aux besoins de la génération actuelle et future. L’objectif de ce cours est donc d’initier les étudiants aux principales problématiques liées à l’environnement ainsi que la politique du développement durable à l’échelle nationale et internationale. Le présent cours est scindé en sept chapitres dans lesquels l’étudiant sera capable de comprendre le concept du développement durable, ses principes et ses outils de mesures. En outre, il sera dans la mesure de connaitre l’historique ayant donné naissance au développement durable ainsi que les différentes réunions internationales permettant d’évaluer la mise en œuvre de la politique environnementale dans le cadre du développement durable. La réglementation et la politique nationale en ce qui concerne la protection de l’environnement sera également abordé au niveau de ce cours.
Techniques d'analyse et de contrôle destiné aux étudiants en licence microbiologie et biotechnologie microbienne
(Université Mouloud Mammeri, 2024) Dermeche, Samia
Dans le présent polycopié sont reprises les différentes parties du cours de méthodes d’analyse et de contrôle, dispensés au premier et du second semestre, à l’intention des étudiants de troisième année Licence Microbiologie et Biotechnologie Microbienne. A travers ce palier d’études de Licence, les techniques qui sont incontournables pour l’analyse biochimique, microbiologiques sont abordées de telles sortes à permettre aux étudiant de saisir les objectifs des méthodes (tant dans un laboratoire de recherche que dans un établissement de contrôle de la qualité), leurs choix selon la nature structurale, la bioactivité des molécules et leur importance dans les différents domaines d’application. Afin d’éviter tout risque sur la santé du consommateur, les examens biochimiques, microbiologiques et hygiéniques jouent un rôle prépondérant dans les domaines alimentaire, cosmétique, pharmaceutique et de la biotechnologie de production. Dans ce contexte, le présent fascicule retrace les grandes lignes menant à la réalisation du contrôle biochimique et microbiologique des produits. Il est scindé en deux chapitres, où sont décrites les techniques d’analyse biochimiques dans le premier puis les techniques de bases d’analyse et de contrôle en microbiologie dans le second. Dans la première partie, sont exposés les méthodes de fractionnement usuelles, indispensables pour l’extraction de biomolécules, suivie des méthodes chromatographiques analytiques et séparatives et des méthodes de dosage. La seconde partie passe en revue sur l’importance du contrôle, les techniques de prélèvements, conditions du transport et la préparation des échantillons qui constituent une étape délicate, très importante et cruciale dans le contrôle microbiologique. Ce chapitre traite les méthodes de dénombrement et les obstacles rencontrées lors du dénombrement qui tiennent surtout aux diverses sources de variation susceptibles d’entacher la fiabilité des résultats (traitement de l’échantillon, modalité de la prise d’essai, mode d’homogénéisation, réalisation des suspensions mères, des dilutions, revivifications des bactéries éventuellement stressées). Il traite également les méthodes de conservation et le contrôle de l’efficacité de stérilisation et des moyens employés pour l’hygiène.
Biotechnologies fongiques et bactériennes
(Université Mouloud Mammeri, 2025) Benazzouz, Kinza
Les Bactéries sont des micro-organismes unicellulaires procaryotes, mesurant entre 0.5 et 5 micromètres. Elles présentent diverses formes : sphériques (coques), en bâtonnets (bacilles), spiralées (spirilles) ou filamenteuses. Leur classification repose sur des critères phylogénétiques (ARNr 16S), morphologiques, métaboliques et tinctoriaux (ex. coloration de Gram). Elles jouent un rôle essentiel dans de nombreux écosystèmes et domaines biotechnologiques. Dans le domaine de l’agriculture, sont utilisées sous forme de biopesticides dans la lutte biologique contre les espèces phytopathogènes, ou utilisées comme biofertilisants (bactéries PGPR) dans l’amélioration de la croissance des plantes. En santé humaine et pharmaceutique, les actinomycètes,sont utilisées dans la production d'antibiotiques, d’autres bactéries sont modifiées génétiquement « OGM » pour la synthèse d'insuline ou d’hormone de croissance, certaines sont utilisées comme probiotiques, ou dans la production de vaccins à base de toxines bactériennes. Dans l’industrie agroalimentaire, Elles sont utilisées dans la fermentation (les bactéries lactiques) et dans la bioremédiation environnementale(traitement des sols et eaux pollués). Les mycètes aussi, offrent plusieurs avantages dans le domaine de la biotechnologie. Ce sont des espèces microscopiques, eucaryotes, unicellulaires ou pluricellulaires, appartenant au règne des mycètes. Ils ont de nombreuses applications. En agroalimentaire, les champignons sont utilisés dans la fermentation (ex. Saccharomyces cerevisiae), la production de protéines, de vitamines et de métabolites industriels comme l’éthanol et l’acide citrique. En pharmacologie, ils sont la source de molécules thérapeutiques majeures (pénicilline, céphalosporine, griséofulvine, ergot) et de polysaccharides immunostimulants. En agriculture, certains champignons (comme Beauveriabassiana) sont employés dans la lutte biologique, d’autres participent à la nutrition des plantes via les mycorhizes. Enfin, en environnement, leur capacité à dégrader la lignine et leur usage en biomining (extraction de métaux) sont étudiés. Ce module propose une exploration approfondie des microorganismes (bactéries et champignons) utilisés dans les biotechnologies modernes. Il permet ainsi aux étudiants d’acquérir une vision intégrée des potentialités biotechnologiques des microorganismes dans des contextes applicatifs variés.
Biologie de la reproduction des angiospermes L3 BPV
(Université Mouloud Mammerie, 2025) Mahammed Ouali, Dinar
Le polycopié soumis par l’auteur, le Docteur MAHAMMED OUALI Dinar, est destiné à l’enseignement du cours de Biologie de la Reproduction des Angiospermes. Ce manuel est destiné aux étudiants en cursus universitaire de Biologie ou des filières Agronomiques jusqu’à la licence. Le contenu du cours illustré est organisé en huit petites parties: la première présente succinctement quelques généralités reproductives des Angiospermes. La seconde, traite de l’organisation d’une plante d’Angiospermes (monoïque et dioïque), suivie de la troisième partie, bien détaillée, décrivant les types d’inflorescences et l’organisation des fleurs d’Angiospermes mono et dicotylédones. La quatrième partie est consacrée à la formation de l’appareil reproducteur ou fleur (organogénèse et déterminisme génétique), puis de la formation des organes reproducteurs de la fleur. Les six, sept et huitièmes parties sont consacrées successivement aux modes de pollinisation, à la double fécondation et enfin à la description des fruits et des graines chez les Angiospermes.

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