Caractérisation phénotypique et génotypique de la résistance aux antibiotiques et aux métaux lourds chez des souches d'Escherichia coli pathogènes aviaires
| dc.contributor.author | Meguenni, Nacima | |
| dc.date.accessioned | 2017-11-22T09:22:23Z | |
| dc.date.available | 2017-11-22T09:22:23Z | |
| dc.date.issued | 2016 | |
| dc.description | 175f. ; 30Cm. + CD- Rom | en |
| dc.description.abstract | L'étude a consisté à évaluer par l'antibiogrammela sensibilité aux antibiotiques de souches aviaires d'Escherchia coli (n=308), de la région centre de l'Algerie,isolées de lésions de colibacilloses et de détecter les mécanismes sous tendant la résistance à deux principales familles d'antibiotiques : les bêta-lactamines et les fluoroquinolones. Des taux de résistance variables ont été observés vis-à-vis des antibiotiques.Le taux de résistance le plus important a été observé vis-à-vis des aminopénicillines (66,2%). Des taux de résistances moyens ont été observés vis-à-vis des aminosides, des tétracyclines et de l'association triméthoprime-sulfaméthoxazole (cotrimoxazole).l'imipénème et la colistine demeurent les molécules remparts avec 0% et 0,68% de résistance, respectivement. La résistance aux quinolones classiques comme l'acide nalidixique (55,2%)a été conséquente, tandis qu'elle a été plus faible vis-à-vis des fluoroquinolones.Des profils de multirésistance associant entre 3 et 17 antibiotiques et s'étendant à toutes les familles chimiques ont été observés. Le principal mécanisme de résistance aux bêta-lactamines a été la production se bêtalactamases.Les groupes phénotypiques prédominants ont été la production de pénicillinases à large spectre (51,9%) transférables par conjugaison et de bêtalactamases à spectre étendu (BLESE) (7,8%), non transférable ni par conjugaison, ni par électrotransformation, alors que les résistances à la tétacycline ou au triméthoprime-sulfaméthoxazole ont été transférables par électrotransformation.L'identification moléculaire des BLSE chez 11 souches par PCR, puces à ADN et séquençage a montré qu'elle appartenaient au groupe 1 de la famille CTX-M,et l'allèle bla ctx-m15 a été détecté chez 2 souches.Le gène bla tem a été détecter chez la plupart des souches BLSE testées. La résistance aux quinolones associée aux BLSE n'a pas été transférable et la recherche de mutation dans les régions QRDR des gènes des sous unités GyrA de ADN gyrase et ParC/ParE ( de la topoisomérase IV)scez 2 souches a mis évidence des mutations classiquement décrites dans les gènes des 3 sous-unités : gyrA : Ser83Leu, Asp87sn;parC: Ser80Iso et parE: Ala458Aer.le typage moléculaire des11 soches BLSE par leurs profils plasmidiques des profils plasmidiques similaires comprenant 7 plasmides et le replicon-typing a mis en évidence des groupes d'incompatibilité IncF et IncFIB.La PFGE pratiquée sur les souches a révélé aussi des profils de macrorestriction identiques.l'analyse phylogénétique a montré leur appartenance au phylogroupe D.Tous ces résultats sont inficatifs du caractère clonal de ces souches.Le second volet de ce travail a porté sur l'évaluation de la sensibilité de 215 souches vis-à-vis de sept métaux lourds à des concentrations critiques définissant l'état de résistance. A l'exception du cuivre, cette étude a mis en exergue des taux de résidtance parfois élevés, tels que vis-à-vis du zinc(79,1%), du plomb (59,1%) et du chrome (45,6%). Des taux plus faibles ont été enregistrés vis-à-vis de l'argent, (17,7%), du cdmium (11,6%) et du mercure (8,4%).Une diversité de profils de résistance (29) a été observée, avec 24 métallotypes de multirésistance associant jusqu'à 5 métaux simultanément et la prédominance du métallotype associant zinc, plomb et chrome (20,5%).L'analyse des correspondances multiples (ACM) et les valeurs du test d'indépendance du x2 (p<0) a clairement établie la liaison entre la résistance aux antibiotiques et la résistance aux métaux lourds chez les souches testées.Ceci va dans le sens d'une probable pression de co-sélection, d'ou une adaptation, exercée sur nos souches via mésusage des antibiotiques et un environnement de plus en plus pollué par les métaux lourds. | en |
| dc.identifier.citation | Microbiologie | en |
| dc.identifier.uri | https://dspace.ummto.dz/handle/ummto/1550 | |
| dc.language.iso | fr | en |
| dc.publisher | Universite Mouloud Mammeri | en |
| dc.subject | Pathogènes aviaires | en |
| dc.subject | Antibiotique : résistance | en |
| dc.subject | Métaux lourds : résistance | en |
| dc.title | Caractérisation phénotypique et génotypique de la résistance aux antibiotiques et aux métaux lourds chez des souches d'Escherichia coli pathogènes aviaires | en |
| dc.type | Thesis | en |
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